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DNA シーケンス

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DNA シーケンスとは

DNA シーケンスとは、DNA(デオキシリボ核酸)のヌクレオチドの正確な配列を決定するプロセスです。塩基としても知られる4つの化学構成要素(アデニン、グアニン、シトシン、チミン)の順序のDNAシーケンシングは、DNA分子内で発生します。DNA シーケンシングの最初の手法は、1970年代半ばにフレッド・サンガー(Fred Sanger)、ウォルター・ギルバート(Walter Gilbert)、アラン・マクサム(Allan Maxam)によって開発されました。配列決定された最初の DNA 断片は、大腸菌にのみ感染する T4 バクテリオファージというウイルスのものでした。ヒトゲノム計画の完了以来、大規模シーケンシングのための新しい手法が数多く開発されてきました。技術の改善と自動化により、研究室で、年間100兆をはるかに超える塩基をシーケンシングできる基準に達しています。大規模シーケンシングのために、多くの新しい方法が開発されています。これらの新しい方法は、多数の短い DNA 断片、または染色体全体を対象とすることができます。

DNA シーケンシング手法

DNA シーケンシングには主に 2 つの種類があります。 DNA シーケンシング手法

  • サンガー法:ジデオキシ法とも呼ばれ、古典的なチェインターミネーション法です。この方法は、現在でも、比較的長いDNA配列を少量で決定するために使用されています。しかし、多数の分子を迅速にシーケンシングする必要がある場合は、高コストで作業の手間がかかるという理由から、最良の選択ではありません。
  • ハイスループットシーケンシング(HTS)法:次世代シーケンシング(NGS)法とも呼ばれています。NGSでは、精度と速度が改善され、さらに作業工数とコストの削減が可能になりました。

ハイスループットシーケンシング法の実装により、ゲノミクスの用途が拡大しました。DNAシーケンシングは現在、基礎科学、橋渡し研究、医療診断、法医学に不可欠なものとして使用されています。

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